200 millió fehérje térszerkezetét tárta fel egyetlen év alatt a DeepMind fehérjekutató algoritmusa

A Qubit a szabad és tájékozott magyar nyilvánosságért dolgozik. Segítsd a munkánkat!

Egyetlen év alatt kétszázszorosára növelte teljesítményét az AlphaFold2, a Google anyavállalata, az Alphabet fehérjekutató algoritmusa. A bárki számára hozzáférhető AlphaFold Fehérje Adatbázisban mára mintegy 200 millió fehérje szerkezetéről gyűjthetnek adatokat a kutatók. 

Az AlphaFold2 mélytanuló algoritmus teljesítményéről a DeepMind kutatói először tavaly július adtak hírt a Nature folyóiratban, ezzel egyidejűleg pedig a nyíltan elérhetővé tették az akkor a program által megjósolt mintegy egymillió fehérjeszerkezetet. A program alkotói ismertették, milyen adatok alapján dolgozik az AlphaFold: a fehérjékről minden meglévő strukturális, genetikai és evolúciós információt felhasznál. Már akkor fény derült az emberi sejtek által kifejezett összes fehérjének, az emberi proteomnak az algoritmus által feltárt térszerkezetére, ezeket a főbb genetikai modellélőlények proteomjával együtt publikálták.

A proteomika évtizedek óta a molekuláris biológia sarokkövének számított, a fehérjék működésének a megértéséhez ugyanis elengedhetetlen a proteinek térbeli szerkezetének ismerete, valamint annak a folyamatnak a megértése, hogyan jön létre a háromdimenziós térszerkezet a fehérje aminosavláncának a feltekeredése során. Bár a sejtek élettani működésének és patológiás folyamatainak feltárásához, csakúgy, mint a megfelelő gyógyszerek előállításához elengedhetetlen a fehérjék pontos térszerkezetének ismerete, kísérleti módszerekkel több évtized alatt is, a több milliárdból csak mintegy 100 ezer fehérje pontos térszerekezetét sikerült meghatározni.

A DeepMind kutatói szerint az elmúlt egy év bizonyította, hogy a mesterséges intelligencia alapú kutatási eszköztár minden korábbi elképzelésnél jobban fel tudja gyorsítani a tudományos munkát. Mint írták, adatbázisukat egy év alatt 190 országból mintegy félmillió kutató kereste fel, közel kétmillió fehérjestruktrúrát használtak a munkájukhoz. A DeepMind kutatói által a Nature-ben publikált tanulmányokra egy év alatt több mint négyezer alkalommal hivatkoztak.

Kapcsolódó cikkek a Qubiten: